La mention 2nd degré du master MEEF prépare les étudiants aux métiers de professeur de lycée et collége (PLC), professeur de lycée professionnel (PLP) et de professeur de lycée technologique (PLT). La mention 2nd degré est assurée en collaboration avec les 3 université s de l'académie de Bordeaux : université de Bordeaux (UB), université Bordeaux Montaigne (UBM) et université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA) et l’institution scolaire (rectorat de l'académie de Bordeaux,  collèges, lycées...).

Trois concours possibles :
CAPES : certificat d'aptitude au professorat du 2nd degré, pour enseigner en lycée général ou en collège
CAPLP : certificat d'aptitude au professorat en lycée professionnel. Spécificité : 2 matières d'enseignement.
CAPET : certificat d'aptitude au professorat en lycée technologique
Lieux de formation : selon le parcours choisis, les enseignements ont lieu sur les sites INSPÉ de Gironde ou des Pyrénées-Atlantiques, l'université de Bordeaux (campus Talence ou Pessac), l'université Bordeaux Montaigne (Pessac) ou l'université de Pau et des Pays de l'Adour (Pau).